the book, I wrote down some notes

Giải thích: 

Khi mệnh đề trạng ngữ và mệnh đề chính có cùng một chủ ngữ, có thể lược bỏ chủ ngữ ở mệnh đề trạng ngữ và đưa động từ về dạng V_ing khi mệnh đề ở dạng chủ động. 

Để nhấn mạnh hành động ở mệnh đề trạng ngữ xảy ra trước hành động ở mệnh đề chính ta dùng dạng: having + P2. 

Câu đầy đủ: After I had read the book, I wrote down some notes. 

Câu rút gọn: Having read the book, I wrote down some notes. 

Tạm dịch: Sau khi đọc cuốn sách, tôi đã viết ra một số ghi chú. 

Chọn D.