Sử dụng kết quả tính tối ưu hóa cấu trúc để thấy được cấu trúc hình học của phân tử H2O.

Trả lời:

Cách tiến hành:

Bước 1. Mở phần mềm Avogadro. Chọn lệnh File ⟶ New ⟶ Display Settings (Cài đặt hiển thị) ⟶ Display Types (Kiểu hiển thị) ⟶ Ball and Stick (Quả cầu và que nối). Sau đó chọn lệnh Build ⟶ Cartesian Editor (Hình 11.1a), một cửa sổ xuất hiện cho phép dán toạ độ Descartes của phân tử để hiển thị cấu trúc.

Bước 2. Mỡ file kết quả tính "H2O_AM1.out" thu được ở trên, đi đến đoạn văn bản sau:

Bước 3. Copy các dòng toạ độ Descartes này dán sang vị trí mô tả toạ độ Descartes tương ứng ở cửa sổ Cartesian Editor của giao diện Avogadro. Nháy chuột vào Apply rồi nháy vào giao diện Avogadro, hình ảnh cấu trúc hình học phân tử H₂O xuất hiện trên màn hình Avogadro

Các bước hiển thị các tham số cấu trúc:

• Hiển thị độ dài các liên kết

Chọn lệnh View→ Properties ⟶ Bond Properties.

Một bảng số liệu độ dài của các liên kết xuất hiện ở màn hình

• Hiển thị góc các liên kết

Chọn lệnh View ⟶ Properties ⟶ Angle Properties.

Một bảng số liệu các góc liên kết xuất hiện ở màn hình, nói tiếp phía dưới của độ dài liên kết.

Lưu ý: Các giá trị kết quả mà em thu được có thể có sai khác so với kết quả trên.